Les principaux objectifs des examens de bactériologie médicale sont les suivants :

• Identifier la ou les bactéries impliquées dans un processus infectieux et déterminer leur sensibilité aux antibiotiques

• Détecter le portage de certaines bactéries

• Etudier l'épidémiologie des infections communautaires et nosocomiales

• Déterminer le statut immunitaire du patient vis-à-vis d'une bactérie

• Suivre l'évolution d'une infection traitée ou non

Afin d'aboutir à un résultat de qualité et donc à un service rendu optimal au patient, l'examen de microbiologie est conditionné par différents éléments.

La phase pré-analytique (de la réalisation du prélèvement à sa réception au laboratoire) est cruciale, c'est pourquoi nous vous demandons de suivre les préconisations suivantes :

Prélèvement à visée diagnostique

• A réaliser si possible au début du processus infectieux avant toute antibiothérapie ou après une " fenêtre antibiotique "

• Les échantillons sont recueillis dans des récipients stériles, étanches et à usage unique

• Les prélèvements profonds ou invasifs sont les meilleurs prélèvements car ils ne sont pas contaminés par les flores commensales. Ils sont réalisés en prenant compte du rapport bénéfice/risque pour le patient. Afin de pouvoir rechercher des bactéries anaérobies, ces échantillons sont immédiatement conditionnés en évitant tout contact avec l'air.

• Les prélèvements superficiels réalisés par écouvillonnage doivent être réservés aux prélèvements des téguments ou des muqueuses.

Recueil des éléments cliniques pertinents

• Pour certains examens de bactériologie, la connaissance du contexte clinique conditionne leur prise en charge.

• Les éléments cliniques demandés doivent donc être complétés.

Acheminement au laboratoire

• Les échantillons doivent être acheminés au Laboratoire au plus près de l'acte de prélèvement.

Processus analytique

Les délais de mise à disposition des résultats mentionnés dans le catalogue ont été définis par défaut pour une culture négative.

Les identifications de micro-organismes sont réalisées par spectrométrie de masse.

La sensibilité aux antibiotiques est réalisée par méthode de diffusion en milieu gélosé ou par détermination des CMI.

Conservation des prélèvements, souches et extraits d'ADN

Les durées de conservation des échantillons sont mentionnées dans la rubrique spécifique de chaque examen.

Toutes les souches isolées sont conservées au minimum un mois.

Les extraits d'ADN sont conservés au minimum un an.